Сюжет экшена разворачивается в альтернативной реальности в Чикаго. Повсеместно идет информационная война. Город полностью автоматизирован передовой компьютерной системой CtOS. Эта система примечательна тем, что полностью контролирует улицы, станции, аэропорты, проводимые мероприятии, содержит информацию о жителях и т.д.

Но Канада и энергетическая станция США подверглись атаке хакеров, что бы нарушить работоспособность системы CtOS. Главный герой Эйден Пирс профессиональный хакер, владеющий боевым искусством. Очерненный в глазах общественности он жаждет восстановить справедливость и принимает участи в информационной войне. Его цель расправиться с Джозефом Демарко – медиа – магнатом незаконно оправданным за совершенное убийство.

В экшене Watch Dogs Эйден Пирс – может взламывать главный компьютер и подчинять себе всю систему. Он может прослушивать мобильные телефоны, нарушать связь, отключать светофоры и выведывать любую информацию для достижения поставленной цели.